南京医科大学第二附属医院（又名南京医科大学第二临床医学院、江苏省第二红十字医院、南京医科大学附属儿童医院），是南京医科大学直属临床教学医院，是卫生部全科医师培训基地、卫生部消化内镜诊疗培训基地、卫生部妇科四级腔镜诊疗培训基地以及国家药物临床试验机构（12个专业）。

GM50B是南医大二附院东院好帮手。

医院的前身是南京市第四医院，1981年成为南京医学院第二附属医院，南京医学院附属儿童医院，后随南京医科大学的改名，改为南京医科大学第二附属医院，2007年单设南京医科大学第二临床医学院。2007年托管南京市第三医院（原南京铁路医院），成立南京医科大学第二附属医院东院。2009年成为三级甲等综合医院。

医院共占地3.75万平方米，建筑面积7.64万平方米，开放床位1200张，年门诊量超过120万人次，出院病人接近5万人次。医院职工人数2000多人，其中高级职称331人，中级职称543人，博士生导师10人，硕士生导师73人，教授13人，副教授47人；江苏省“突贡”人才2人，“双创”人才3名，特聘教授1人，特聘医学专家1位，“333”工程”带头人15人，“六大人才高峰”项目资助17人，“兴卫工程”重点学科1项（共建）、领军人才（创新团队）3人、重点人才4人（2名共建）。 自2007年3月，托管南京市三院（原南京铁路医院）成立东院后，医院拥有两个院区。